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Apr 26, 2024

Detecção de vírus respiratórios no trato respiratório superior de pacientes comunitários assintomáticos

BMC Infectious Diseases volume 22, Número do artigo: 411 (2022) Citar este artigo 1572 Acessos 3 Citações 46 Detalhes das Métricas Altmétricas A prevalência de positividade do vírus no trato respiratório superior

BMC Infectious Diseases volume 22, número do artigo: 411 (2022) Citar este artigo

1572 acessos

3 citações

46 Altmétrico

Detalhes das métricas

A prevalência de positividade do vírus no trato respiratório superior de idosos assintomáticos residentes na comunidade permanece indefinida. Nosso objetivo foi investigar a prevalência de positividade de PCR para vírus respiratórios em idosos assintomáticos residentes na comunidade, utilizando amostras de saliva e swabs nasofaríngeos e orofaríngeos.

Analisamos 504 adultos residentes na comunidade com idade ≥ 65 anos, ambulatoriais e inscritos em um estudo transversal realizado de fevereiro a dezembro de 2018 na cidade de Nagasaki, Japão. Quatorze vírus respiratórios foram identificados em amostras de saliva, nasofaringe e orofaringe por meio de ensaios de PCR multiplex.

As prevalências de positividade de PCR para rinovírus, influenza A, enterovírus e qualquer vírus respiratório foram 12,9% (IC 95%: 10,1–16,1%), 7,1% (IC 95%: 5,1–9,8%), 6,9% (IC 95%: 4,9–9,5%) e 25,2% (IC 95%: 21,5–29,2%), respectivamente. O rinovírus foi detectado em 21,5% dos indivíduos, a gripe A em 38,9% dos indivíduos, o enterovírus em 51,4% dos indivíduos e qualquer vírus em 32,3% dos indivíduos utilizando apenas amostras de saliva.

As prevalências de vários vírus respiratórios foram superiores às percentagens relatadas anteriormente em amostras faríngeas de adultos jovens. A amostragem de saliva é um método potencialmente útil para detecção de vírus respiratórios em populações assintomáticas.

Relatórios de revisão por pares

A implementação da reação em cadeia da polimerase (PCR) em ambientes clínicos mais amplos facilita a detecção rápida e precisa de vírus respiratórios, revelando os vírus respiratórios como patógenos comuns de pneumonia adquirida na comunidade [1,2,3]. Alguns estudos relataram a prevalência de positividade do vírus no trato respiratório superior de indivíduos assintomáticos [4,5,6]; no entanto, a prevalência em idosos residentes na comunidade susceptíveis a doenças graves quando infectados ainda não foi investigada.

A detecção viral respiratória na nasofaringe usando métodos de biologia molecular é um método padrão para detectar infecções respiratórias virais [7]. No entanto, as amostras de saliva são amostras alternativas potenciais; a amostragem de saliva é menos invasiva e está associada a um risco menor de transmissão do que a amostragem de esfregaço nasofaríngeo (NP). O benefício da amostragem de saliva para detecção de vírus baseada em PCR foi relatado em pacientes infectados com vírus respiratórios comuns e síndrome respiratória aguda grave coronavírus 2 (SARS-CoV-2) [8,9,10,11,12].

O objetivo principal deste estudo foi investigar a prevalência da detecção de vírus respiratórios por PCR em idosos assintomáticos residentes na comunidade no Japão. O objetivo secundário foi explorar o possível uso de saliva além da amostragem faríngea para vigilância da prevalência em populações assintomáticas.

Esta análise foi implementada no âmbito do seguinte estudo existente: “A baixa prevalência de pneumococo entre idosos residentes na comunidade: um estudo transversal no Japão” [13]. Todos os métodos foram conduzidos de acordo com a Declaração de Helsinque e o estudo foi aprovado pelo Conselho de Revisão Ética do Instituto de Medicina Tropical, Universidade de Nagasaki, Nagasaki, Japão, e pelos conselhos de revisão institucional de cada centro de estudo. O consentimento informado por escrito foi obtido de todos os participantes ou de suas famílias. O estudo foi realizado de fevereiro de 2018 a dezembro de 2018 na cidade de Nagasaki, Japão. Incluímos idosos residentes na comunidade com idade ≥ 65 anos que eram ambulatoriais e frequentavam consultas clínicas regulares ou consultas ambulatoriais de reabilitação em 4 hospitais na cidade de Nagasaki, Japão. Excluímos pessoas com febre ou quaisquer sintomas de infecção do trato respiratório superior, pessoas que receberam tratamento com antibióticos nos 30 dias anteriores e pessoas que foram internadas em um hospital ou instituição de longa permanência por ≥ 7 dias nos 30 dias anteriores. As informações demográficas e clínicas detalhadas dos 504 participantes foram descritas anteriormente [13]. Amostras NP e orofaríngeas (OP) foram obtidas utilizando dois swabs: uma amostra da nasofaringe utilizando um swab esterilizado com haste de alumínio (TE2201) (Eiken Chemical Co., Tóquio, Japão) e outra amostra da orofaringe utilizando um swab esterilizado com uma haste de madeira (TE8201) (Eiken Chemical Co., Tóquio, Japão). Esses swabs foram imediatamente colocados individualmente em 1 ml de meio de leite desnatado-triptona-glicose-glicerol (STGG) [14]. Os participantes foram solicitados a cuspir no interior de um recipiente de escarro esterilizado (DE2000) (Eiken Chemical Co., Tóquio, Japão) para coletar saliva pura sem escarro. Os detalhes do uso desses cotonetes e recipientes de escarro esterilizados estão disponíveis on-line no fabricante [15]. As amostras foram coletadas por pesquisadores ou enfermeiros pesquisadores treinados. Os ácidos nucleicos virais foram extraídos usando um kit QIAamp viral RNA Mini (QIAGEN Inc., Valencia, CA, EUA) e QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN Inc., Valencia, CA, EUA), e os seguintes quatorze vírus respiratórios foram selecionados com multiplex Ensaios de PCR usando um kit One Step RT-PCR (QIAGEN Inc., Valencia, CA, EUA) para vírus RNA e GoTaq Flexi DNA Polymerase (Promega, San Luis Obispo, CA, EUA) e PCR Nucleotide Mix (Promega, San Luis Obispo , CA, EUA) para vírus de DNA, conforme descrito anteriormente [16]: influenza A, influenza B, vírus sincicial respiratório (RSV), metapneumovírus humano (hMPV), vírus parainfluenza tipos 1–4 (PIV-1, PIV-2, PIV-3 e PIV-4), rinovírus, coronavírus 229E, OC43 (coronavírus humano comum [HCoV]), adenovírus, bocavírus e enterovírus. Um arquivo adicional 1 mostra a sensibilidade (limite de detecção) do PCR multiplex [ver arquivo adicional 1]. A prevalência de positividade da PCR para vírus respiratórios foi definida como a prevalência total detectada em pelo menos uma amostra de NP, OP e/ou saliva. O cálculo da prevalência de positividade da PCR é mostrado no arquivo adicional 2: Fig. S1. O coeficiente kappa de Cohen (κ) foi calculado para medir a concordância entre cada par de locais de amostragem.